很多重庆人都习惯将重庆站喊成菜园坝火车站，这样显得尤为亲切。上世纪50年代，随着成渝铁路的通车，菜园坝火车站也成了城中最闹热的地方之一。但随着铁路的不断发展，菜园坝火车站已经无法满足人们的出行需求，伴随着重庆北站、重庆西站建成投用，菜园坝火车站日渐萧条。目前仅承担成渝、川黔铁路的始发终到普速旅客列车，以及少量襄渝、兰渝铁路的始发终到旅客列车，每天发送旅客仅千余人。
重庆站虽然也经历过几次大的改造，但经过多年的风霜雨雪，很多设施已经陈旧，整体形象也有些老土。加上附近交通拥堵、环境脏乱差等问题，菜园坝火车站渐渐淡出了人们的视线。近年来，关于菜园坝火车站的去留问题，也一直饱受争议。2010年，国家发改委明确批准，重庆站作为成渝高铁重要过站式枢纽，纳入改建车站范围，自此这座古老的车站终于迎来了“新生”。
4月4日，重庆市政府官网发布《重庆市人民政府办公厅关于做好2019年市级重大项目实施有关工作的通知》，文件公布了2019年市级重大项目包括年度建设项目和前期规划研究项目，其中就包括菜园坝火车站（重庆站）的改造建设。建设工期为2020-2023年，建设规模及主要建设内容：将对重庆站实施综合改造，包括铁路站场、市政交通及配套设施等，今年内完成可行性研究报告。报告显示根据规划，始发站重庆站将由现在的菜园坝火车站改建而成。
渝黔铁路从重庆站出发后，下一个站点就是重庆东站，两站距离21.11公里，虽然不是全线最远的两个相邻站，但却有一江之隔。如何让位于渝中半岛的重庆站和南岸茶园的重庆东站相连呢？最好的方法就是建一条过江隧道。
过江隧道如何走？环评报告中指出了具体走向：重庆站出站后下穿菜园坝立交，依次下穿轨道三号线、在建曾家岩隧道、石黄隧道、轨道十号线，经十八梯传统风貌改造片区，于金紫门公运物流公司货场处下穿长江，越江后下穿南滨路、在建轨道环线上浩站、内环快速和南山至刘家坪，上跨纵一路、石塔立交由北向南引入重庆东站。
据悉，这条重庆长江隧道总长11942米，约11公里，最大埋深322米，是全线控制性工程，也是重庆的首条过江隧道。
另外菜园坝站新建高架候车室横跨在铁路轨道上
重庆站是渝黔高铁的起点站，它地处重庆市渝中区长江边上，菜园坝立交以西、菜袁路以北，最多聚集人数为10000人。环评报告指出：该站为重庆枢纽主要客运站，渝黔高铁引入重庆站后与成渝客专贯通。车站按高速场、城市列车场自北向南分场布置，总规模7台14线，其中高速场4台8线，预留1台2线。
重庆站站房将按高架候车室布置，就是候车室以空中建筑的形式跨越车站内的站台和轨道。相关人士表示，高架候车室是火车站的分层设计，候车室和站台立体化错位布置，能有效节约横向平面空间，目前沈阳、大连、长春等城市的大型车站都建有高架候车室。
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